羊食管堵塞的发病原因有原发性和继发性两种。
原发性食管堵塞：主要是因为羊采食马铃薯、甘薯、甘蓝、萝卜、芜菁等块根块茎类饲料时，吞咽过急；或因采食大块豆饼、花生饼、玉米棒以及谷草、稻草、青干草等，未经充分咀嚼，急忙吞咽而引起。
继发性食管堵塞：常见于食管麻痹、狭窄和扩张。也有由于中枢神经兴奋性增高，发生食管痉挛，采食中引起食管堵塞。继发性阻塞见于异嗜癖、食管狭窄、扩张、憩室、麻痹、痉挛及炎症等病程中。
多因过度饥饿，采食过急，采食中突然受惊吓，咀嚼不全，吞咽过猛，食团阻塞于食道而致病。阻塞物常为块状饲料，如甜菜根、马铃薯、甘蓝根、甘薯、萝卜及西瓜皮等。有时也可因异物引起，如瓶盖、毛巾、布片、毛线球等。