物理消毒分为热消毒、机械消毒、光照消毒等方法。热消毒，即提高温度来杀死细菌，降低了病原体的活性程度甚至直接杀死，常见的是燃烧粪便之类的做法；机械消毒，即对猪圈以及猪经常接触的物品、地方进行定时、成规模的定期消毒；光照消毒法，将猪及猪接触过的东西搬到阳光下，利用阳光中的紫外线杀死病原体及细菌，但阳光中的紫外线杀伤力弱，所以一般猪圈内采用紫外灯的方法来杀死病原体及细菌，达到净化生活环境及空气的目的。化学消毒，即利用化学试剂来消毒，一般都是购买已经配好的杀菌消毒的药水来进行喷洒，但在使用过程中一定要注意其酸碱性，避免一些碱性试剂在酸性的环境中使用。生物消毒，即利用微生物的分解作用及发酵作用来产生消毒的产品。