羊黑疫病程急促，绝大多数未出现病状突然死亡。病程1~2天，病羊掉群，不食，呼吸困难，流涎，体温升高41.5℃左右，最后昏睡呈俯卧状态死去。临床症状与羊快疫、羊肠毒血症等相似。病程很短，突然死亡。个别病程稍长，主要表现为神志不清，呼吸困难，不能进食，反刍停止，体温可升至41℃以上，一般延迟1~2天即昏睡卧床死亡。病羊尸体皮下静脉显著充血，观察为黑色，故称之为羊黑疫。病羊胸部皮下浮肿，浆膜腔积液，在空气中容易凝固，腹腔液稍微红一点。肝脏充血肿胀，有一个或多个凝固性坏死灶，坏死灶界限清晰，可达2~3cm，切面呈半圆形。