感染部位不同，临床症状也有所不同，当病原体侵害羊蹄部时，引起腐蹄病。病初多为单肢患病，随着病情发展，跛行严重。蹄部检查可见蹄间隙、蹄踵、蹄冠等处皮肤苍白、肿胀、表面变软，有疼痛反应，而后局部溃烂，挤压溃烂处可见发臭的脓样炎性渗出物流出，在溃烂处周围形成结痂，随着病情加重，病羊的腱、韧带和关节等处发生坏死，有的蹄匣脱落。病羊食欲不振，体温升高，行走困难甚至长期卧地不起，如果治疗不及时，可能因转移性病变或继发感染而死亡。
发生坏死性口炎的病初患羊体温升高，流涎、鼻漏、有口臭，可见鼻、唇、舌、口腔等处出现结节、水泡，随后形成棕色痂块，剥脱后露出不规则溃疡面，极易出血，病情较轻者很快恢复。治疗不及时导致病情加重，后期齿龈肿胀、疼痛、牙齿脱落不能进食，身体逐渐消瘦，肝、肺，心等脏器表面出现坏死灶，引起多种器官发生病变，出现全身症状。
常发腐蹄病，病初跛行，且日趋严重，仔细观察，有时不见创口，但蹄部发热肿大，极为疼痛，不久在两趾间或蹄后部的皮肤出现坏死区，并可蔓延到滑液囊、腱、韧带和关节。有些病例蹄底溃烂，引起内部组织广泛坏死，以致蹄匣脱落，坏死灶中充满灰黄色恶臭脓汁。治疗护理不当时，经久不愈，最后造成蹄的畸形或继发脓毒败血症。