牛传染性角膜结膜炎是一种多病原的疾病，主要由牛摩勒氏杆菌引起。该菌是一种长1.5～2.0微米，宽0.5～1.0微米的革兰氏阴性杆菌，多成双排列或短链状，有荚膜，无芽孢，不能运动。在强烈太阳紫外光照射下才会产生典型症状。单独感染眼或仅用紫外线照射，均不能引起此病或仅产生轻微症状。本菌对理化因素抵抗力弱，一般浓的加热至59℃的消毒剂，5分钟即可杀菌。病菌离开病畜后，在外界环境中存活一般不超过24小时。
