预防的主要措施是消灭野狗，凡有经济价值的狗定期驱虫，加强肉品检验工作，有病器官按规定处理。对牧羊犬和家犬至少每个季节进行1次驱虫，常用驱虫药物：吡喹酮，按每千克体重5-10毫克，1次灌服；氢溴酸槟榔碱，按每千克体重1-4毫克，1次灌服，服药后拴留一昼夜。
就现阶段的发展，比较可靠的方法是手术摘除棘球蚴或切除被寄生的器官。避免犬、狼、豺、狐狸等终末宿主吞食含有棘球蚴的内脏是最有效的预防措施。另外，疫区之犬经常定期驱虫以消灭病原也是非常重要的，如驱犬绦虫药阿的平，按每千克体重0.1-0.2克，一次口服。