第一、消毒的主要目的是杀灭传染源的病原体，猪传染病的发生要有三个基本环节：传染源，传播途径，易感动物。在畜禽养殖中，有时没有疫病发生，但外界环境存在传染源，传染源会释放病原体，病原体就会通过空气、饲料、饮水等途径，入侵易感猪群，引起疫病发生。如果没有及时消毒，净化环境，环境中的病原体就会越积越多，达到一定程度时，就会引起疫病的发生。因此，未发生疫病地区的养殖户更应进行消毒，防患于未然。
第二、消毒预防是疫病防治的关键措施之一，但不是唯一措施。尽管进行了消毒，但并不一定就能收到彻底的消毒效果，这与选用的消毒方法有关，就是已经彻底规范消毒后，短时间内很安全，但许多病原体可以通过空气、飞禽，老鼠等媒介传播，养殖动物自身不断污染环境，也会使环境中的各种致病微生物大量繁殖，所以必须定时、定位、彻底、规范消毒，同时结合有计划地免疫接种，才能做到猪只不得病或少得病。
第三、传统的消毒剂对病原微生物的作用直接杀灭或者抑制其生物活性，但消毒剂没有选择性，不但可以奢靡哦或者抑制病毒细菌等，也同样作用于动物的活体细胞，雾化的消毒液通过猪的呼吸对呼吸道黏膜造成伤害，破坏了呼吸道免疫屏障，从而使致病菌能够长驱直入，导致呼吸道病发病高，当我们对子宫阴道消毒时，就是对猪的泌尿生殖粘膜进行破坏，既降低了动物子宫等自我免疫防御能力，更易导致不发情，返情，产仔少等繁殖障碍。
第四、饮水消毒除可引起猪只急性中毒外，主要是对猪的消化道黏膜进行破坏，不但危害猪的消化吸收功能，而且增加肠道感染发病的危险性。
（以上为本站整理农技人员经验所得，仅供参考）