牛囊虫病的诊断主要依靠宰后检验。在肌肉或一些器官中发现的牛囊虫呈黄豆大小,白色,半透明,囊泡内充满液体,囊壁上有一个小米粒大的头节。严重感染的牛初期体温升至40-41℃,出现腹泻、食欲降低、反刍减少或停止,粘膜苍白,呼吸困难和心跳加快,后期可能卧地死亡。这些症状虽无特异性,但结合宰后检验中发现的牛囊虫可以确诊。