羊快疫、羊肠毒血症、羊猝狙、羊黑疫等疾病发病迅速，几乎无法治疗，需以免疫预防为主。常用疫苗为“羊快疫—羊猝狙—羊肠毒血症”三联苗或“羊快疫—羊猝狙—羊肠毒血症—羔羊痢疾—羊黑疫”五联苗，皮下注射5毫升，2周后产生免疫力，保护期半年以上。对病程较长的病羊，可使用抗生素、磺胺类药物和肠道消毒剂，并采取强心、输液、解毒等疗法。
山羊传染性胸膜肺炎可通过接种山羊传染性胸膜肺炎氢氧化铝菌苗预防，6个月以下的山羊3毫升，6个月以上的山羊5毫升，注射后14天可产生可靠免疫力，免疫保护期为1年。对病羊可使用土霉素、四环素、氯霉素、卡那霉素、链霉素等进行治疗，连用5～7天，可取得一定疗效。
乳房炎的治疗包括清洗乳房并处理乳房外伤，对发热的乳房冷敷，及时挤出乳房中变质的乳汁。药物治疗可用糖盐水、安乃近、四环素静脉注射，注意补充碳酸氢钠以解除酸中毒症状。中药疗法可使用新鲜蒲公英、通草、白芷、土贝母、瓜蒌根、马齿苋、赤小豆、冬瓜皮、丝瓜络、野菊花、大蓟等药材。
绦虫病是秋冬季最常见的山羊寄生虫病。预防绦虫病，使用20%的生石灰水或5%的克辽林溶液喷洒。洗刷羊舍、饲具。预防性驱虫可使用吡喹酮或硫双二氯酚，前者用量为每公斤体重12毫克，后者用量为每公斤体重60～80毫克。药物治疗方法有：口服1%的硫酸铜，1～6个月的羔羊用15～45毫升，7个月以上的羊用45～100毫升；或口服砷制剂，如砷酸铅、砷酸亚锡、砷酸钙，羔羊0.5克，成年羊1克，然后供给油类泻剂，帮助排出虫体；或氯硝柳胺（灭绦灵），每公斤体重50～75毫升，1次口服。