蓝耳病防控的关键在于饲养管理，特别是早春及秋冬季节，昼夜温差大，保温和通风很难兼顾，环境中湿度、空气质量、温差等如果控制不好会直接导致蓝耳病不稳定。此外，由于环境问题导致的支原体等疾病，也会导致呼吸道黏膜受损，加速蓝耳病的传播。因此，防控蓝耳病，除了做好基础免疫外，必须做好猪舍环境控制。
李肖岚研究表明，猪舍做好驱虫，控制好猪舍内的温湿度、光照，减少环境应激，可以增强猪只抵抗力。加强猪只的营养供给，也有助于提升猪只的抵抗力。引种会导致蓝耳病传播，最好是自繁自养；如必须引种，一定要经过严格的检测及隔离。合理的饲养密度，也是饲养管理的重要一环。日常病弱猪需要及时挑出，单独护理，有条件的猪场可以将病猪放到隔离舍单独护理。