在鱼苗孵化过程中，提前脱膜和畸形胚胎等现象时有发生，严重影响孵化率。提前脱膜多发生在胚胎发育的尾鳍出现至肌肉效应期，卵膜破裂或溶解，失去保护的胚体沉底死亡。发生原因包括鱼卵质量差或过熟、孵化池内壁粗糙、放卵密度过大、水质差以及多个孵化池共用循环水导致先入池的鱼卵释放酶影响后入池鱼卵。
防治措施有：打磨粗糙的孵化池内壁，控制每立方米水体放卵80万粒左右；保持水质清洁，调节PH值至7～8；发现提前脱膜可关小进水阀，用5～10ppm高锰酸钾溶液处理5～8分钟。
畸形胚胎主要由于鱼卵过熟、亲鱼营养不良、水温剧变或水质不良引起。防治需加强亲鱼培育，选择适宜时机催产。
剑水蚤是孵化阶段主要敌害，会破坏鱼卵和仔鱼。防治措施包括严格过滤水源，发现剑水蚤可关小进水阀并用80％敌敌畏乳剂（200毫升/立方米）处理10～30分钟，或在供水口挂装有敌百虫的塑料瓶。