鱼种下塘前需消毒，常用消毒药液为2%—3%盐水或2%—3%呋喃西林水溶液以及1%浓度高锰酸钾溶液。一般采用药浴消毒法，将鱼种放入药液中浸泡5分钟—10分钟，注意观察鱼在药液中的活动状态，及时取出以免造成死亡。
下池后进行水体消毒，一般选用二氧化氯或者碘制剂兑水全池泼洒。需要注意的是，在这个阶段应避免使用强氯精类消毒剂和颗粒型消毒剂。
