淡水石斑鱼体型为纺锤型，口上位。其躯干两侧各有8条黑纹，垂直黑条纹中央有较黑的色素块。胸鳍淡黄色，腹鳍、背鳍、臀鳍皆具有黑色条纹，尾鳍黑色条纹与身体垂直。
淡水石斑鱼体一般呈椭圆或长椭圆形，侧扁；头长大于体高；背鳍鳍棘部强大，与鳍条部相连，背鳍鳍棘7~11根，鳍条10~21根；臀鳍鳍棘3根，一般第2根最为强大，臀鳍鳍条数7~13根；胸鳍宽大，位低，一般呈圆形；腹鳍位于胸鳍下方；口大，两颌齿内行齿倾倒；体被小栉鳞；侧线达尾鳍基部；尾鳍圆形、截形或凹型。
