鳗鱼凹凸病是由微孢虫寄生引起的。它病程缓慢但难以治疗，传播性强，鱼体表面一旦形成凹凸即失去商品价值，是一类危害性较大的疾病。本病流行期无特殊限制，在15℃～30℃的水中皆可感染，温度愈高孢子发育愈快。该病对幼鳗危害尤为严重，日本鳗、欧洲鳗均可感染。
目前此病尚无理想的治疗方法，主要以防为主：
（1）放养前宜翻土晒干，并用大剂量（每亩150公斤左右）生石灰清塘。
（2）收购过程中小心观察鱼体，避免购进病鳗。
（3）饲养时避免密度过大，保持水质良好，起捕、分选中发现病鳗应立即挑出处理。
（4）发病后可尝试升温治疗，将水温缓慢升至34℃～35℃（每天升温2℃左右），保持3～4天后再降至正常，其间减少投饵量和换水次数。注意若与其他疾病并发不可贸然升温。另可口服烟曲霉素，每吨鳗每天用50毫升拌饲投喂，连续服药5天停1天，反复4次。