稻田养鱼是一种生态种养模式，正常情况下，是不使用化学农药防治病虫害的，而是用频振式杀虫灯、性引诱剂等物理方式杀虫。养鱼稻田在施用农药前，应逐渐排水把鱼类集中到鱼坑、鱼沟里，排水的目的是将鱼类赶到水深的鱼坑里去。鱼类赶到鱼坑后，还应加深水位，扩大鱼坑载鱼量。鱼类进入鱼坑后，要隔绝鱼坑与稻田的沟通，避免农药流进鱼坑而毒死鱼类。
提高水位到8cm以上，这样施用农药时一旦有药物进入水体则稀释了药物的浓度，减少其对鱼类的危害。在稻田里施用农药，一定注意将药物施入在水稻所在水体内。养鱼稻田施用农药时的注意事项有：天气突变、闷热天气时不能施用农药，这是因为气候突变时鱼类会出现一时不适，如果在此时施用农药多会毒死鱼类；下雨天气不能施用农药，这是因为下雨天气时施用的农药会顺着已经被雨打湿了的禾秆流入田中，等于在田水中施用农药，鱼类较难承受；施用液体农药时应选择晴天下午禾苗晒干时进行，并要求对准禾叶喷洒，而不能朝着田面喷洒，以免药液入水伤鱼；撒施粉剂药物时应选择晴天清晨有露水时进行，可利用露水的湿润黏住农药，从而达到消灭害虫的目的。