鱼菜共生系统显示出它在任何时间和地点生产可持续食品的真正潜力。水产养殖与水耕栽培的结合，是再循环系统中植物高效栽培的一种“清洁环保”方式，可遵循以下七项规则：
一、审慎选择饲养池
鱼池是鱼菜共生单位的重要组成部分，尽量使用耐用的塑料或玻璃钢水箱，最好为圆形，池底平坦或呈锥形，以便保持清洁。
二、确保通风和水循环
使用水泵和气泵让水体含有充足的溶解氧并流动，确保养殖动物、细菌和植物的健康。电费是主要开支，大型项目应考虑光伏发电。
三、保持良好水质
五项主要参数需要监测：溶解氧（5毫克/升）、pH值（6-7）、温度（18-30℃）、总氮和水碱度。可使用通用测试套件实施检测。
四、控制饲养密度
建议放养密度为20千克/1000升。较高的放养密度需要更积极的管理。
五、避免过度饲喂
每天投喂30分钟后清除剩余食物，防止腐烂危害水质。根据实际情况调整第二天的投喂量。
六、合理种植布局
在生长期长的植物间种植短期蔬菜，利用大型植物为嫩叶蔬菜提供自然遮荫。绿叶蔬菜与果实类蔬菜混栽效果良好。
七、维持系统平衡
采用批量耕作系统确保稳定收成，保持鱼和植物间的平衡。规划阶段要考虑幼苗和鱼种的持续供应问题。