合理的通风系统设计是保证鸡舍内空气流通的基础。鸡舍通风系统应包括进风口和出风口，以保持空气的流动。进风口应设置在鸡舍的上部，以便引入新鲜空气。出风口应位于鸡舍的底部，以排出废气和潮湿空气。进风口和出风口的位置、数量和尺寸应根据鸡舍的大小和鸡的数量来确定，以保证通风效果的最佳化。
通风系统的运行管理要注重维持合适的温湿度。在秋冬季，温度和湿度的变化较大，因此鸡舍通风系统需要根据实际情况进行调整。一般来说，白天鸡舍内温度较高，通风量可以适当增加，以降低温度。而夜晚温度较低，通风量可以适当减小，以避免鸡只受凉。此外，鸡舍内湿度过高也会影响鸡只的健康，因此通风系统应能有效排除潮湿空气，保持适宜的湿度。
另外，通风系统的维护保养也是至关重要的。鸡舍通风系统中的进风口和出风口应定期清洁，以防止积尘和堵塞。风扇等设备也需要定期检查和维修，确保其正常运行。鸡舍的墙壁、天花板和地面也要保持清洁，避免细菌滋生和疾病传播。