病原体感染是导致牛小叶性肺炎的主要原因之一。牛小叶性肺炎的主要病原体包括牛结核杆菌、牛冠状病毒、牛病毒性腹膜炎病毒等。这些病原体可以通过空气飞沫、直接接触、粪便等途径传播给健康牛群，引发疾病的发生。
环境因素也对牛类发生牛小叶性肺炎起到重要作用。密集养殖环境、空气污染、不良的通风条件等都会增加牛小叶性肺炎的发病风险。牛场内因饲养密度大、排泄物积累等导致空气质量下降，病原体易于传播和繁殖，从而增加了牛小叶性肺炎的发生概率。
此外，牛类的生物学特性也与牛小叶性肺炎的发病有一定关系。牛类在生理发育上较其他动物较为缓慢，免疫系统的发育也相对较慢，这使得牛易于感染病原体。特别是年龄较小的牛，免疫力相对较弱，更容易受到感染和发展为牛小叶性肺炎。