牛传染性角膜结膜炎的临床症状可以分为眼部症状和全身症状两类。眼部症状是最突出和常见的症状，包括眼结膜充血、眼球发红、眼泪增多以及结膜下积液等。
牛患牛传染性角膜结膜炎后，其眼结膜会明显充血，呈鲜红色或深红色。眼球表面也会发红，并且可能出现肿胀的现象。另外，由于炎症的刺激，牛眼部分泌液会增多，常常有眼泪不断流淌的情况。此外，牛的结膜下可能会产生积液，导致眼球看上去肿胀。
除了眼部症状外，牛传染性角膜结膜炎还会出现一些全身症状，包括食欲减退、体温升高、精神萎靡、乳产量下降等。当牛患有这种疾病时，其食欲会明显减退，食物摄入量会减少。同时，牛的体温可能会升高，超过正常范围。精神状态也会受到影响，牛可能会显得疲倦、无精打采。此外，由于疾病的影响，牛的乳产量也会下降。