传染性法氏囊病感染鸡后，免疫系统的炎症反应会被激活。病毒的侵入会引发免疫细胞释放细胞因子，如白细胞介素和肿瘤坏死因子，从而诱导炎症反应。这些细胞因子可以吸引更多的免疫细胞进入感染区域，加强免疫反应。感染还会导致鸡体内抗体水平的变化，免疫系统会开始产生病毒特异性抗体，以中和和清除病毒。这些抗体可以通过淋巴系统和血液循环到达感染部位，帮助抑制病毒复制和传播。然而，长期暴露于病毒环境中，鸡体内的抗体水平可能会逐渐下降，从而降低免疫功能。此外，传染性法氏囊病的感染还会影响鸡体内的免疫细胞数量和功能，特别是T细胞，这是一类在免疫反应中起重要作用的细胞。感染还可能导致巨噬细胞的活性下降，从而减弱对病毒的清除能力。