肺部病变是牛传染性胸膜肺炎的主要病理特征。在剖检中，可以观察到肺组织的颜色发生变化，从正常的红色变为暗红色或灰白色。此外，肺组织质地变硬，触摸时不易恢复原状。剖检中还可以发现肺部出血灶，以及肺泡和支气管充满了黏液和脓液。
胸膜炎是牛传染性胸膜肺炎剖检中另一个重要的特征变化。在剖检中，可以观察到胸膜表面呈现出不同程度的红斑、充血和炎症。此外，胸腔内还可能有大量的积液，导致胸膜间隙变宽。
牛传染性胸膜肺炎还可能引起其他器官的病理变化。例如，心包炎和心肌炎是该疾病的常见并发症，剖检时可以观察到心包和心肌的充血、出血和炎症。肝脏和脾脏也可能受到影响，肝脏和脾脏组织可能呈现充血和出血的特征。