与奶牛产后血红蛋白尿相鉴别的是肾炎。肾炎是指肾脏发生炎症，导致尿液异常。与奶牛产后血红蛋白尿不同，肾炎尿液中除了血红蛋白外还可出现蛋白质，白细胞和管型。此外，肾炎患牛常伴有其他症状，如食欲不振，发热，腹痛等。
与奶牛产后血红蛋白尿相鉴别的还有输尿管结石。输尿管结石是指在输尿管内形成的结石，导致尿液异常。与奶牛产后血红蛋白尿不同，输尿管结石的尿液中常见有尿液混浊，尿频，尿急等症状。此外，输尿管结石还可引起下腹痛和腰酸痛。
此外，与奶牛产后血红蛋白尿相鉴别的还有尿路感染。尿路感染是指泌尿系统受到细菌感染，导致尿液异常。与奶牛产后血红蛋白尿不同，尿路感染的尿液中除了血红蛋白外还可见白细胞和细菌。此外，尿路感染还常伴有尿频，尿急，尿痛等症状。