新生犊牛病毒腹泻的一大症状是腹泻。腹泻是该疾病的主要表现，犊牛的粪便会变得水样或稀薄，并具有恶臭味。腹泻严重时，犊牛可能会频繁排便，每天排便次数增多，甚至超过十次。这种腹泻会导致犊牛体内水分丢失过多，引起脱水。
新生犊牛病毒腹泻还会引起犊牛的食欲不振。患病的犊牛可能表现出食欲下降，对食物缺乏兴趣，甚至拒绝进食。这样会导致犊牛摄取营养不足，影响其生长发育。
新生犊牛病毒腹泻还可能引发其他症状，如发热、呕吐等。犊牛患病后往往会出现体温升高的情况，体温可达到39℃以上。此外，有些犊牛还可能出现呕吐的情况。