细菌属于原核生物界，是单细胞生物，没有叶绿素。细胞内没有完整的细胞核，仅有分散的核质而无核膜。细菌体形很小，大约500~1000个杆菌首尾相接才有一颗小米粒长。
细菌的形状有球状、杆状和螺旋状三种。为害植物的病原细菌都是杆状的。其中多数细菌体外有鞭毛，着生位置多数为端生，少数为周生。鞭毛是运动器官，在水中能摆动。有少数细菌体外包有一层较厚的透明的粘胶物质，称为荚膜。有荚膜的细菌抗干燥。当环境条件不适宜时，有些细菌能产生芽孢。芽孢是由于细胞原生质浓缩、细胞壁加厚而形成的。当环境条件转好时，芽孢又可以发芽生长和繁殖，但植物病原细菌一般不形成芽孢。