菏泽的市花是牡丹花,其种植历史可追溯至明清时期,当时已成为全国最大的牡丹繁殖加工中心。2012年,菏泽被票选为中国牡丹之都,并拥有世界上最大的牡丹繁殖加工基地。菏泽的牡丹种类繁多,花色艳丽,每年5月至6月底是牡丹的盛花期,此时曹州百花园、凝香园、中国牡丹园等景点对外开放,供游客欣赏牡丹的美丽。
牡丹的历史悠久,已有1500年的种植记录,清朝时被尊为国花,1985年入选中国十大名花。牡丹花以其大气优雅、超凡脱俗的气质著称,成为菏泽市的文化象征。