导致拱棚南瓜烂蔓的主要病害为灰霉病和菌核病，严重的植株则为两种病害混发。对于这两种病害，菜农们应该都已非常熟悉，但为什么还发展如此严重呢？记者认为：主要是棚内的小气候决定的。最近气温变化较大，尤其是拱棚内昼夜温差大，低温潮湿导致了两种病害的发生。所以说，要想彻底防治这两种病害，首先要改善拱棚内的小气候。
首先，严格控制棚内温度。据当地菜农反映，现在棚内白天最高温度在35℃以上，而夜间拱棚内温度只有10℃左右。因夜间温度较低，造成前半夜棚内雾气较重，易在植株表面形成水珠或露珠层，这种高湿环境有利于这两种病害的发生。所以，当前最主要的工作是要严格控制棚内温度，白天农业新闻要加强通风，控制棚温在30℃左右，利于降低棚内湿度。下午5点左右及早关风，利于保持夜温。
其次，不要一次性浇水过多。因白天气温高、蒸发量大，植株需水量变大，有些菜农一次性浇透水，不仅导致棚内湿度较大，还容易造成夜间植株叶片吐水现象，加重病害发生。对此，建议菜农可以小水勤浇，不要一次性浇水过多。
再次，及时摘除老叶、病叶，增加透光度。由于南瓜单叶面积大，叶面积系数过大易造成株行间的拥挤，株行间透光性降低。所以应及时疏除部分遮阴叶、耗养叶，在增加植株透光度的同时，利于果实的着色。
改善棚内环境是前提，但一定要跟上药剂防治，因棚内病原孢子较多，为了彻底杀灭两种病害孢子，最好选用菌核净熏棚。一般每亩使用200g，熏棚6-7小时，效果较好。