缺氮症植株生长缓慢，初期老叶呈黄绿色，后期全株呈浅绿色，叶片细小、直立。叶脉由黄绿色变为深紫色。茎秆变硬。果实变小、补救方法：可将碳酸氢铵或尿素等混入10～15倍液的腐熟有机肥中施于植株两侧后覆土浇水，也可在叶面上喷洒0.2%碳酸氢铵溶液。
缺磷症早期叶背呈紫红色，叶片上出现褐色斑点，叶片僵硬，叶尖呈黑褐色枯死。叶脉逐渐变为紫红色。茎细长且富含纤维。结果延迟。预防及补救方法：育苗期及定植期要施足磷肥，也可用0.2%～0.3%磷酸二氢钾溶液叶面喷施。
缺钾症初期叶缘出现针尖大小黑褐色点，后茎部也出现黑褐色斑点，叶缘卷曲。根系发育不良。幼果易脱落或多畸形果。预防及补救方法：在多施有机肥基础上，施足钾肥，可在植株两侧开沟追施硫酸钾，施后覆土。也可用0.2%～0.3%磷酸二氢钾溶液或1%草木灰浸出液叶面喷施。
缺钙症植株瘦弱、萎蔫，心叶边缘发黄皱缩，严重时心叶枯死，植株中部叶片形成黑褐色斑，后全株叶片上卷。很系不发达。果实易发生脐腐病及空洞果。预防及补教方法：施用适量右灰，也可在番茄生长期或发现植株缺钙时，用0.3%～0.5%氯化钙水溶液叶面喷施，每隔3～4天喷施1次，共2～3次。
缺镁症下部老叶失绿，后向上部叶扩展，形成黄花斑叶。严重的叶缘上卷，叶脉间出现坏死斑，叶片干枯，最后全株变黄。预防及补救方法：施足腐熟的有机肥，增施含镁肥料，也可在番茄生长期或发现植株缺镁时，用1%～3%硫酸镁溶液叶面喷施。
缺硫症叶色淡绿向上卷曲，植株呈浅绿色或黄绿色。后心叶枯死或结果少。补救方法：增施硫酸铵等含硫肥料。
缺硼症最显著的症状是叶片失绿或变桔红色。生长点发暗，严重时生长点凋萎死亡。茎及叶柄脆弱，易使叶片脱落。根系发育不良变褐色。易产生畸形果，果皮上有褐色斑点。补救方法：发现植株缺硼时，用0.1%～0.2%硼砂水溶液叶面喷施，每隔5～7天喷1次，连喷2～3次。
缺锰症中部叶片或老叶呈浅绿色，后幼叶失绿，叶片上出现网状纹，脉间失绿呈浅黄色。补救方法：发现植株缺锰，可用1%硫酸锰溶液叶面喷施。