黑木耳的人工栽培，有多种方式及模式，其菌袋的制作，则应根据栽培模式决定，不能一概而论。
1菌袋及其适应模式：
长菌棒：使用扁宽17-20厘米、长80厘米左右的聚丙烯塑袋，机械装料，两头扎口，常规高压0.15兆帕灭菌2小时，或常压灭菌10-12小时。如果灭菌灶一次性装料达到500千克以上，则需相应延长灭菌时间。菌棒式栽培模式为：菇棚吊袋出耳、仿段木栽培等。
大菌袋：一般使用扁宽20-28厘米、长45厘米左右的聚丙烯塑袋，大小如同平菇菌袋，两头扎口，灭菌等均常规。大袋式栽培模式为：层架式出耳，适合集约化生产，但由于棚、架的一次性投资较高，故适合仿工厂化栽培以及有投资能力的生产者。
立式菌袋：一般使用扁宽20-28厘米、长30-35厘米的聚丙烯封底塑袋，每袋装料0.5-0.7千克，其栽培模式为：地栽模式、床架模式等。
2接种：一般可根据菌袋的大小或装料的多少确定接种方式，如立式菌袋可一头接种，也可采用“梅花接种法”，即在菌袋周身打四排约6个接种孔，接入菌种后用胶布封口；长菌棒和大菌袋，每袋可装料2-3千克，菌袋表面积较大，必须采用“梅花接种法”，具体接种孔数量，可根据用种量、发菌时间等确定。
3发苗管理：培养室事先进行清洁处理，并按计划整理地面，兑配20-30倍蘑菇祛病王或800倍百病去无踪进行地毯式喷洒，并密闭棚室，2天后即可将菌袋移入进行发菌管理。菌袋的排放，视当时温度的高低和菌袋的大小而定，立式菌袋因其短小，可以排放6-10层，大菌袋和长菌棒可采取井字型排放方式，一般不要超过6层，但当温度低于18℃时，可适当加高2层左右。发菌期间应调控温度在22℃以上，最好保持在25℃左右；空气湿度在75%左右；每2天左右通风一次；并密闭光线。培养第3天，接种块即可萌发，10天左右，菌丝生长速度加快，菌袋内有热量产生，并排出二氧化碳，因此，发菌10天以后，应逐渐加大通风量，并可适当降低温度；发菌第20天以后，由于菌丝的活跃程度达到高峰，生物量的加大使菌袋内温度亦达到最高，所以，应加强通风管理。发菌期间，结合管理，应将检查剔杂作为重点，发现诸如红、黄、黑，灰白等色泽各异的菌袋剔出，另行处理，具体可参考菌种等发菌管理，不再赘述。
4菌丝后熟：一般经约40天左右，即可完成发菌，此时，不要急于进入出耳阶段，调控温度湿度等条件，使菌袋转入后熟期，即使其进行继续发菌，以最大程度的继续分解基料、增加生物量、储备出耳能量，以达到一旦进入出耳管理，即可形成爆发出耳的生产效果。一般条件下，可尽量降低温度和湿度，强化通风，约经10天左右，温度低时可延长至20天以上，即可发现大部分菌袋的接种块处有原基现出现，此时，即可转入出耳管理。