1、控制温度
在毛木耳出耳时生长温度要控制在16-35度之间，过高过低都会影响耳片生长，温度低于16度，耳片生长缓慢，高于35度，耳片生长受到抑制。最适宜的温度在24-28度，在这个温度之间，耳片生长极快，另外温度低于20度时，减少通风，使室内温度上升，而高于33度时，加强通风和喷水，是温度降下来。
2、增加湿度
毛木耳在野外都生长在腐木上，所以对于空气湿度也较高，在生长阶段时，要保持空气湿度在85-95%之间。湿度不够的情况下，可人工喷水维持，在喷水也可对耳片直接喷水，但主要还是对地面和空间喷水。喷水要根据气候、天气而定，天气晴朗、温度较高时，喷水量要大，次数要多，而阴雨天、温度低时，则要少喷水或不喷水。当耳片出现边缘变黑发硬时，就代表空气湿度不足，这时就要浇水喷水。
3、加强光照
光照的强度和时长对毛木耳的质量关系较大，在毛木耳菌丝生长阶段是不需要光照的，但到了耳片生长阶段则需要一定的散射光。光照不足，耳片的颜色暗淡，茸毛短而细；而光照充足，耳片颜色深，茸毛长而粗，所以在耳片生长期要加强光照，产出优质的毛木耳，满足市场需求。
4、保持通风
毛木耳在耳片生长期需要吸收大量的氧气，排出二氧化碳，如果室内环境通风不佳，使空气不流通，造成室内二氧化碳的浓度较高，使耳片不能正常生长分化，最终发育不良。而且到了耳片生长后期，高温高湿环境会造成流耳现象，所以更要加强通风，保持空气清新。
5、采收管理
毛木耳在管理正常的情况下一年可采收3-4茬，其中以第一第二次的质量较好，第三次后的品质较差。在第一次采收后要及时将残存的耳基及时除净，以免出现霉烂情况，导致污染，无法再次出耳。在采收一次后停止喷水、加强通风、加强光照是菌丝在袋中继续吸收养分，为第二茬出耳提供强壮的菌丝体条件。