玉米丝黑穗病主要通过土壤传播病菌，病菌能在土壤中存活2～3年，带菌的农家肥也是传播途径之一。此外，该病害还可通过种子表面传播，商品玉米也可能成为传播媒介。预防玉米丝黑穗病的关键在于切断传播途径，主要措施包括选择抗病品种、选用无病地块以及进行药剂拌种。
