辣椒灰霉病的发病原因是品种抗病能力弱，湿度大。冬春低温，多阴雨天气，相对湿度90%以上时，灰霉病发生早且病情严重，排水不良、偏施氮肥田块易发病。病菌以菌核遗留在土壤中，或以菌丝、分生孢子在病残体上越冬，在田间借助气流、雨水及农事操作传播蔓延。病菌较喜低温、高湿、弱光条件。棚室内春季连阴天，气温低，湿度大时易发病。
