辣椒根腐病发病规律与温室度、耕作、连作有关。春季多雨、梅雨期间多雨的年份发病严重,常造成根系腐烂、植株枯死。其传播途径主要分为虫传和接触传染两大类。可借虫传的病毒包括黄瓜花叶病毒、马铃薯Y病毒及苜蓿花叶病毒,与蚜虫和蓟马的发生情况关系密切,高温干旱天气会促进蚜虫传毒并降低寄主抗病性。传播辣椒病毒病的蓟马有茶黄蓟马和棕榈蓟马。烟草花叶病毒通过接触及伤口传播,整枝打杈等农事操作易导致传染。此外,定植晚、连作地、低洼及缺肥地易引发该病流行。