大蒜锈病主要侵染叶片和假茎。发病初期，病部出现梭形褪绿斑，随后在表皮下形成圆形或椭圆形稍凸起的夏孢子堆。表皮破裂后，散出橙黄色粉末状的夏孢子，病斑四周伴有黄色晕圈。随着病情发展，病斑连片导致全叶枯黄，植株提前枯死。生长后期，未破裂的夏孢子堆上会产生黑色冬孢子堆，使表皮破裂。病株蒜头多开裂散瓣。
