病果初生水浸状暗绿色斑，后变褐软腐，具恶臭味，内部果肉腐烂，果皮变白，整个果实失水后干缩，挂在枝蔓上，稍遇外力即脱落。
辣椒软腐病的危害症状受到辣椒软腐病危害的果实，发生部位从伤口处开始，初呈水渍状，暗绿色，后变为暗褐色，除果皮的角质不受细菌侵染，完整不破，果内全部腐烂，并发出恶臭。病果脱落或残留在枝上，残留果逐渐失水变成灰白色或白色，仅余果皮，中空，状似“灯笼”。
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