西瓜枯萎病防治技术主要包括嫁接苗、轮作、土壤消毒和药剂防治。预防西瓜枯萎病的方法有：采用轮作方式，与禾本科或百合科作物实行两年轮作；施用复合微生物菌剂作基肥，每亩150-200kg，用有益菌消灭和抑制病菌，减少病害的发生；在发病初期使用杀菌剂向叶面喷施并灌根，发病后期药物治疗效果有限。此外，选择抗病品种、嫁接栽培、轮作倒茬也是有效的防治措施。座果初期可喷施甲霜恶霉灵或恶霜嘧铜菌酯，或苯菌灵进行灌根防治。亩用绿亨9号340克（绿亨1号85克）+速渡340克，拌60千克细土混匀后撒入定植穴；或用绿亨9号800倍液（绿亨1号3000倍）+速渡800倍液+天宝1500倍液，每定植穴灌500克左右；或用上述药量滴灌。在西瓜坐果前用绿亨1号+速渡+天宝灌根预防1-2次。发病初期用同样药剂灌根。防治西瓜枯萎病最有效的方法是嫁接换根，用葫芦或新土佐等高抗枯萎病的葫芦科作物做砧木嫁接西瓜品种，只要注意彻底断掉西瓜根，苗子栽植时，不使嫁接口部位与土壤接触，就会有效地防止西瓜枯萎病的发生。对没有嫁接的自根苗西瓜，要坚持“以防为主、综合防治”的植保方针，认真抓好农业防治、化学防治等综合防治措施。农业防治为主，药剂防治用“敌克松”或“绿亨4号”喷雾或灌根。