西瓜疫病病菌主要随病残体在土壤中或粪肥里越冬，在第二年借气流、雨水或灌溉水传播，湿度大时得于疫病的发生。由于西瓜地采用浅畦和畦面高低不平、或雨后积水的田块、或连作地、或施用未腐熟有机肥利于西瓜疫病的发生。由于西瓜品种抗病能力的差异性，如无籽西瓜比普通西瓜抗病性强，苗期、伸蔓期比果实膨大期抗病力强。这个病害可通过雨水、灌溉水和壤传播，在温度为28-32℃，相对湿度为85%以上容易高发。另外地势低洼、排水不良、偏施氮肥及施用未腐熟的有机肥，都能引起该病发病严重，以及下雨及浸水后收获的果实，在贮运的过程中极易发生疫病及炭疽病。西瓜疫病在中国各地均有发生，南方发病重于北方，在西瓜生长期多雨年份，发病尤重。中国上海及长江中下游地区西瓜疫病的主要发病盛期在春季4-7月。年度间早春多雨或梅雨期间多雨的年份发病重。