西瓜炭疽病的病原菌主要通过菌丝体在病残体土壤或种子上越冬。次年春季,当西瓜苗出苗后,如果遇到适宜的温度和湿度条件,病原菌即通过风雨传播进行初浸染。之后,病部会再次产生分生孢子,通过风雨继续进行多次重复侵染,从而导致病害的范围不断扩大。病菌可以在病残体土壤或种子上越冬,待第二年西瓜出苗后,在适宜的温湿度条件下通过风雨传播。