苦瓜猝倒病的发病原因主要是土壤温度过低和湿度过大，尤其在夜晚或阴雨天气时发病率最高。病菌以卵孢子在12～18厘米表土层越冬，并在土中长期存活。翌春，遇有适宜条件萌发产生孢子囊，以游动孢子或直接长出芽管侵入寄主。此外，在土中营腐生生活的菌丝也可产生孢子囊，以游动孢子侵染瓜苗引起腐霉猝倒病。田间的再侵染主要靠病苗上产出孢子囊及游动孢子，借灌溉水或雨水溅射传播蔓延，病菌侵入后，在皮层薄壁细胞中扩展，菌丝蔓延于细胞间或细胞内。该病多发生在土壤潮湿和连阴雨多的地方。
