苦瓜病毒病会导致植株矮化、叶片皱缩，因此在种植时选用抗病品种，生长中加强管理，可喷施增产菌、多效好等生长促进剂提高抗病力。发病后可以选用阿克泰水分散粒剂或艾美乐水分散粒剂等进行控制。防治方法包括：选择适于本地种植的高产抗病良种，加强肥水管理，促植株稳定生长，增强抗疫力，并在营养剂中加入0.1％～0.2％的黑皂或肥皂。从植株上架开始，定期或不定期喷施3～4次或更多，有促进植株生长。及时拔除零星病株，并做好防蚜治蚜工作。病后喷施0.1％高锰酸钾液或1.5％植病灵乳剂1000倍液，或5％毒菌清水剂300～500倍液，2～3次，隔7～10天1次。此外，治虫防止病毒借蚜虫和温室白粉虱进行传播，喷洒病毒钝化剂，如用20％病毒A可湿性粉剂400－600倍液，在进行人工摘花、摘果、整枝时也要注意防治。