南瓜细菌性缘枯病的病原在种子上或随病残体留在土壤中越冬,成为第2年初侵染源。病原从叶缘水孔等自然孔口侵入,靠风雨、田间操作传播蔓延和重复侵染。该病的发生主要受降雨引起的湿度变化及叶面结露影响。当湿度上升到70%以上达6~8小时即可发病,结露时间越长发病越重。