南瓜裂瓜的主要原因包括长期干旱或预防病害时过度控水后突降大雨或浇大水，导致果肉细胞大量吸水膨胀，而果皮细胞老化不能同步生长，从而造成果皮开裂。此外，幼果在农事活动或机械操作中受伤，在果实膨大时以伤口为中心开裂。开花时钙物质不足，导致花器缺钙，也会引起幼果开裂。裂瓜还与水分供应不均、温度变化以及缺乏钙硼等因素有关。
