芝麻细菌性角斑病主要为害叶片，叶柄、茎、果梗和蒴果也可受侵害。苗期即可发病，被害幼苗常在苗期死亡。叶上病斑初为水浸状小点，渐扩大为褐色至灰褐色多角形病斑，最后常呈黑褐色，周围有黄色晕圈。病斑还常沿叶脉串连成条斑。在湿润时病斑上有菌脓溢出，而在干燥时造成穿孔。病斑多时常引起附近组织干缩，因而使叶片变形。茎和叶柄上产生黑色条斑，后期病斑表面覆盖一层由菌胶分泌液干燥后所形成的薄膜。芝麻顶部被害后不能继续发育，蒴果病斑黑褐色，近圆形或不规则形。病蒴果内的种子常为黑褐色、干瘪。
