病原以休眠的菌丝或卵孢子在土壤、病残体和种子的胚上越冬，并可在土壤中存活3-5年。苗期进行初侵染，病菌从茎基部侵入。在潮湿条件下，经2-3天病部孢子囊大量出现，从裂开的表皮或气孔成束伸出，并放出游动孢子，经风雨、流水传播蔓延，进行再侵染。在7月份芝麻现蕾时，出现病株，8月上旬开始流行。高温高湿条件下病情扩展迅速，大暴雨后或夜间降温利于发病。持续降雨或高湿度（90%以上）有利于病害大发生。土壤温度在28℃左右，病菌易于侵染和引起发病；而土温为37℃时，病害的出现延迟。
