茄子褐腐病的主要侵染循环是病原菌在土壤、种子或病株残体越冬,温湿度适宜时侵入。病菌主要以分生孢子器和菌丝体随病株残余组织遗留在田间及堆肥中越冬,也能以分生孢子吸附在种子上越冬。在病株残体和休眠种子种皮内的分生孢子器和菌丝体能存活2年以上。