辣椒病害主要有疫病、白粉病、锈病，以及虫害如蚜虫、红蜘蛛等。种植过程中需重点防治的病害包括猝倒、根腐、立枯、枯萎、炭疽、疫病、灰霉、叶霉、菌核、早疫、病毒、晚疫、白粉、褐斑、污霉、白星、斑枯、叶斑、绵腐、青枯、疮痂、软腐、脐腐、日灼和霜霉。虫害方面则需要关注红蜘蛛、朱砂叶螨、茶黄螨、棉铃虫、二十八星瓢虫、烟青虫和稀点雪灯蛾。
