辣椒斑萎病毒病的危害症状包括植株萎缩变矮、生长停止、叶片上有斑点等。感染病毒病后，辣椒的生理代谢会紊乱，叶片皱缩不平，有时会导致生长激素紊乱，顶端出现丛枝症状。在生长点附近的茎和叶片上形成褐色坏死斑，叶片呈土黄色，不久后变成黑褐色枯死。中部叶片偶尔出现不明显的大型黄色轮纹。果实上出现不规则形的黑褐色坏死斑。随着病情发展，全株枯萎，茎上生成褐色条斑并枯死。心叶卷曲展不开，植株矮小不健状，叶片发黄有斑点。
