精选品种。种子、插穗消毒。苗床土壤消毒。田间管理。药剂防治。合理轮作，及时清除清理土壤表面病残体，施用充分腐熟农家肥，深耕，精细整地，采用高畦覆膜栽培。主要是真菌危害根部引起的，水肥不合理，温度高，湿度大可能会加重病害。根腐病，用络氨铜，甲霜灵，乙蒜素，腐植酸铜，枯草芽孢杆菌灌根，连施2-3次，七天一次。根腐病一般都比较难治，要用对药，可以用生物农药，这样没什么毒害，又可以起到防治根腐病的作用，可以用救根护苗做灌根处理就可以了，对治疗水稻根腐病有很好的效果。
