辣椒软腐病在田间低洼、密度过大、钻蛀性害虫多或连阴雨天气多、湿度大易流行。病菌随病残体在土壤中越冬，成为翌年初侵染源。在田间通过灌溉水或雨水飞溅使病菌从伤口侵入，染病后病菌又可通过烟青虫及风雨传播，使病害在田间蔓延。重茬种植，多年发作，尤其是粘土地病残体分解慢，土壤带菌量逐年增加，一旦条件成熟极易发病。种植密度过高，一旦遇有连阴雨，在潮湿通风不畅的情况下，易诱发软腐病。管理粗放，肥水供给和病虫害防治不及时，植株长势弱，落叶、落蕾严重，抗病力降低。由于棉花面积减少，棉铃虫、烟青虫等钻蛀性害虫缺少寄主，故而大量为害辣椒，造成软腐病侵入和流行。部分椒农舍不得花钱买杂交抗病品种，多年种植当地常规退化品种，使得病害连年加重。