杨梅褐斑病主要为害叶片，初期在叶面上出现针头大小的紫红色小点，逐渐扩大为圆形或不规则形病斑，中央呈浅红褐色或灰白色，边缘褐色，直径4~8毫米。后期在病斑中央长出黑色小点，是病菌的子囊果。当叶片上有较多病斑时，病叶就干枯脱落，受害严重时全树叶片落光，仅剩秃枝，直接影响树势、产量和品质。
病菌以子囊果在落叶或树上的病叶中越冬，次年4月底至5月初，子囊果内的子囊孢子成熟，下雨后释放出来的子囊孢子借风雨传播蔓延。孢子从叶片的气孔、伤口侵入，潜伏期3-4个月。一般至当年8-9月才开始在叶面上出现新病斑，10月病斑增多并开始落叶，严重时至第2年的落叶率在70％～80％。落叶后不久，引起花芽和小枝枯死。