水稻褐斑病的病菌在种子和病组织中越冬，从伤口侵入寄主，也可从水孔、气孔侵入。细菌在水中可存活20～30天，随水流传播。病菌主要在病稻种、稻草和自生稻上越冬，成为主要初侵染源。病菌主要从气孔或伤口侵入，借风、雨、露等传播。在无病区主要通过带菌种子传入。暴雨、台风可加重病害发生。偏施氮肥，灌水过多或灌串水，易发病。偏酸性土壤发病重。高温、高湿、阴雨有利于发病。特别是秧苗受伤或受淹后发病重。
